41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2824 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2824  NapD-like protein  100 
 
 
376 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1203  hypothetical protein  48.48 
 
 
340 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.376258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1143  hypothetical protein  44.81 
 
 
338 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  41.21 
 
 
318 aa  253  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  43.23 
 
 
364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1367  acid phosphatase  41.45 
 
 
325 aa  245  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000940717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3412  NapD-like protein  41.78 
 
 
336 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  39.47 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  42.72 
 
 
337 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  41.31 
 
 
337 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  39.93 
 
 
333 aa  239  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.43 
 
 
336 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3491  NapD-like protein  37.79 
 
 
320 aa  236  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  40.13 
 
 
336 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  40.46 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  42.16 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2938  NapD-like protein  41.16 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  41.18 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  36.52 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  40.33 
 
 
337 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  39.43 
 
 
334 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  40 
 
 
346 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  39.2 
 
 
352 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  38.57 
 
 
354 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1878  hypothetical protein  37.91 
 
 
325 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324693  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4638  putative nonspecific acid phosphatase precursor  40.52 
 
 
297 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00694651  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  39.35 
 
 
365 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3847  nonspecific acid phosphatase precursor  36 
 
 
355 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1241  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.3 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0090  nonspecific acid phosphatase precursor  37.82 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3086  nonspecific acid phosphatase precursor  36.96 
 
 
305 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.376229  normal  0.0718813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  34.33 
 
 
339 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.31 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  38.31 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3553  putative nonspecific acid phosphatase precursor  35.86 
 
 
327 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1525  putative nonspecific acid phosphatase  37.14 
 
 
322 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0728936  normal  0.904277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  37.66 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3383  putative nonspecific acid phosphatase precursor  35.53 
 
 
327 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.937467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0570  putative nonspecific acid phosphatase precursor  35.2 
 
 
327 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0764  hydrolase  36.45 
 
 
307 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168912  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0425  hypothetical protein  33.12 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>