53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0085 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1056    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  99.23 
 
 
519 aa  1047    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  100 
 
 
517 aa  1056    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  99.54 
 
 
433 aa  887    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  92.65 
 
 
476 aa  873    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  99.31 
 
 
433 aa  881    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  889    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  99.81 
 
 
517 aa  1055    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  68.07 
 
 
424 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  66.52 
 
 
527 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  71.43 
 
 
425 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  71.43 
 
 
425 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  70.2 
 
 
425 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  70.2 
 
 
425 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  53.18 
 
 
433 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  38.39 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  39.12 
 
 
424 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  38.21 
 
 
422 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  32.4 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  29.89 
 
 
382 aa  179  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  26.47 
 
 
352 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  33.33 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  24.04 
 
 
352 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  24.6 
 
 
351 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  24.3 
 
 
351 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  23.66 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  24.69 
 
 
351 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  25.88 
 
 
352 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  24.21 
 
 
351 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  22.16 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  33.04 
 
 
352 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  23.58 
 
 
352 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  23.58 
 
 
352 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  25.94 
 
 
349 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  33.93 
 
 
364 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  23.32 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  26.84 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  23.32 
 
 
352 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  23.32 
 
 
352 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  25.74 
 
 
353 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  34.82 
 
 
336 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  36.19 
 
 
365 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  35.14 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  32.14 
 
 
358 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3120  NapD-like protein  33.93 
 
 
354 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  31.03 
 
 
341 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  31.86 
 
 
346 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  29.46 
 
 
337 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  29.2 
 
 
340 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  33.03 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003596  putative nonspecific acid phosphatase precursor  29.46 
 
 
333 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3792  nonspecific acid phosphatase precursor  31.25 
 
 
334 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  27.38 
 
 
337 aa  43.5  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>