51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7058 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  84 
 
 
425 aa  740    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  886    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  84.94 
 
 
527 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  84.24 
 
 
425 aa  741    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  85.41 
 
 
425 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  84.94 
 
 
425 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  71.43 
 
 
433 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  71.18 
 
 
517 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  71.18 
 
 
519 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  71.18 
 
 
433 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  71.18 
 
 
517 aa  594  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  70.93 
 
 
519 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  70.92 
 
 
476 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  70.68 
 
 
433 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  51.89 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  41.75 
 
 
440 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  40.36 
 
 
424 aa  299  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  35.73 
 
 
422 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  32.19 
 
 
382 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  32.9 
 
 
396 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  23.94 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  25.88 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  26.41 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  25.49 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  25.21 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  24.67 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  25.49 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  25.49 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  25.18 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  25.59 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  24.23 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2251  nonspecific acid phosphatase precursor  37.84 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  24.47 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5556  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  34.62 
 
 
354 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2133  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like  33.33 
 
 
352 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  35.71 
 
 
336 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  35.58 
 
 
364 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6682  putative nonspecific acid phosphatase, NapD-like protein  33.65 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2981  NapD-like protein  30.97 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0598995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4528  nonspecific acid phosphatase precursor napD-like protein  30.7 
 
 
358 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0141528  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1196  NapD-like protein  33.88 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  30.36 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1238  NapD-like protein  31.25 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.596763  normal  0.131697 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8071  NapD-like protein  31.4 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  30.36 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.46 
 
 
336 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>