48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0094 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0094  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  778    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000042098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0244  putative lipoprotein  38.89 
 
 
440 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.482265  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3340  hypothetical protein  34.29 
 
 
424 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8503  hypothetical protein  33.76 
 
 
433 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7058  hypothetical protein  32.19 
 
 
424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.291657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4908  phosphoserine phosphatase  31.54 
 
 
425 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.433606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4967  hypothetical protein  31.27 
 
 
425 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139442  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3400  twin-arginine translocation pathway signal  30.87 
 
 
527 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3280  hypothetical protein  31.36 
 
 
422 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.439147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5319  hypothetical protein  31 
 
 
425 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0878389  normal  0.0141688 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4389  phosphoserine phosphatase  31 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0881  hypothetical protein  29.89 
 
 
433 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1041  phosphoserine phosphatase  29.89 
 
 
519 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0878  hypothetical protein  29.89 
 
 
433 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0338  hypothetical protein  29.89 
 
 
519 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.249122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0085  hypothetical protein  29.89 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712977  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0637  hypothetical protein  29.89 
 
 
517 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.210974  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2471  hypothetical protein  29.89 
 
 
433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0283788  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0700  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  29.31 
 
 
476 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1977  hypothetical protein  31.38 
 
 
396 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1127  hypothetical protein  25.88 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11950  lipoprotein lppF  22.25 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0335  hypothetical protein  24.53 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6065  phosphorylcholine phosphatase  33.59 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69870  phosphorylcholine phosphatase  33.59 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5003  hypothetical protein  23.41 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0243051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5130  hypothetical protein  23.91 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5182  hypothetical protein  24.53 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3709  hypothetical protein  22.19 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3112  nonspecific acid phosphatase  29.84 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.880914  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3052  nonspecific acid phosphatase  33.63 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5134  nonspecific acid phosphatase precursor  27.93 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261937  normal  0.117341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4738  hypothetical protein  29.65 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0595  hypothetical protein  22.26 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.164758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0144  hypothetical protein  22.26 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.69592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0627  hypothetical protein  22.26 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2758  hypothetical protein  27.21 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.530384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0552  hypothetical protein  21.96 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0528  hypothetical protein  21.96 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4345  putative nonspecific acid phosphatase precursor  26.92 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966913  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4114  putative nonspecific acid phosphatase precursor  26.44 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0702959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4189  putative nonspecific acid phosphatase precursor  26.44 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0436  hypothetical protein  28.57 
 
 
352 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0900  NapD-like protein  33.33 
 
 
341 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5359  hypothetical protein  24.29 
 
 
353 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2894  putative nonspecific acid phosphatase precursor  28.68 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851127  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5769  NapD-like protein  29.46 
 
 
337 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6905  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.68 
 
 
336 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>