233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3921 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03366  predicted cytochrome C peroxidase  99.71 
 
 
465 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.157341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0195  Cytochrome-c peroxidase  99.71 
 
 
465 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3821  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.71 
 
 
465 aa  713    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.057161 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0199  cytochrome-c peroxidase  99.71 
 
 
465 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.910181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3721  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.71 
 
 
465 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03319  hypothetical protein  99.71 
 
 
465 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.08517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3921  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  100 
 
 
350 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4880  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  99.71 
 
 
465 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4103  cytochrome-c peroxidase  79.24 
 
 
466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  78.95 
 
 
466 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  79.24 
 
 
466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  79.24 
 
 
466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  78.95 
 
 
466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  74.27 
 
 
463 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  55.29 
 
 
459 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  55.29 
 
 
459 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  55.29 
 
 
459 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10230  Di-heme cytochrome c peroxidase, CCP_MauG family  48.7 
 
 
464 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06375  cytochrome c peroxidase  49.66 
 
 
437 aa  315  8e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  44.48 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1091  Cytochrome-c peroxidase  47.74 
 
 
459 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000159552  hitchhiker  0.0000000000000391154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1488  cytochrome-c peroxidase  48.57 
 
 
322 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0300205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  46.82 
 
 
328 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2947  cytochrome-c peroxidase  48.26 
 
 
317 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0431502  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  50 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0088  cytochrome c551 peroxidase  44.89 
 
 
306 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  48.31 
 
 
333 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  51.72 
 
 
339 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  48.57 
 
 
333 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1877  cytochrome-c peroxidase  48.85 
 
 
330 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.54832  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2827  cytochrome-c peroxidase  47.98 
 
 
377 aa  159  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  50.86 
 
 
333 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  49.72 
 
 
346 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0020  cytochrome c551 peroxidase  48.54 
 
 
304 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  46.93 
 
 
330 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  48 
 
 
353 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  49.14 
 
 
371 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  48.54 
 
 
304 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  48.82 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  47.67 
 
 
384 aa  156  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1187  cytochrome c551 peroxidase  49.71 
 
 
352 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0823128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  49.43 
 
 
331 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  49.7 
 
 
346 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  48.28 
 
 
351 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1506  Cytochrome-c peroxidase  46.99 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  44.94 
 
 
352 aa  153  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  42.2 
 
 
314 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  46.24 
 
 
330 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  47.43 
 
 
333 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  46.45 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  46.29 
 
 
333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  46.29 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  46.24 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1263  cytochrome c peroxidase  47.19 
 
 
358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  46.29 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0372  cytochrome-c peroxidase  43.75 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.393962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  46.29 
 
 
333 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0893  cytochrome-c peroxidase  44.38 
 
 
340 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.849776  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60700  cytochrome c551 peroxidase precursor  44.94 
 
 
346 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  46.07 
 
 
345 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  44.57 
 
 
344 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  44.57 
 
 
344 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5227  cytochrome c551 peroxidase precursor  44.38 
 
 
346 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  44.57 
 
 
344 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  44.57 
 
 
344 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1789  cytochrome-c peroxidase  41.75 
 
 
348 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0019  Cytochrome-c peroxidase  44.69 
 
 
345 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  43.23 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  43.27 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  43.82 
 
 
345 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2655  cytochrome-c peroxidase  43.78 
 
 
350 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.872358  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0466  cytochrome c551 peroxidase  43.26 
 
 
346 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3091  di-haem cytochrome c peroxidase  42.7 
 
 
346 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  38.89 
 
 
332 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0407  cytochrome c551 peroxidase  47.83 
 
 
341 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2527  cytochrome-c peroxidase  43.01 
 
 
359 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0382  cytochrome c551 peroxidase  47.83 
 
 
341 aa  138  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1377  cytochrome-c peroxidase  40.38 
 
 
347 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2395  BCCP, cytochrome c peroxidase  44.69 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1058  cytochrome-c peroxidase  44.69 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0622508  normal  0.212255 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  45.96 
 
 
344 aa  132  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2671  Cytochrome-c peroxidase  42.47 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1539  cytochrome c551 peroxidase  48.19 
 
 
344 aa  130  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  44.1 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  42.68 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  36.81 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  46.05 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  42.86 
 
 
330 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0394  cytochrome c551 peroxidase  40.12 
 
 
351 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.194468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  40.22 
 
 
768 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3903  Cytochrome-c peroxidase  37.79 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0419  Cytochrome-c peroxidase  44.63 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000661029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  42.13 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0214  cytochrome-c peroxidase  44.64 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  39.43 
 
 
337 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  40.25 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06168  cytochrome c551 peroxidase  41.25 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  40.24 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2106  cytochrome-c peroxidase  35.47 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  39.88 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>