185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1951 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1951  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 601 aa  1204    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0200915  normal  0.205413 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.62 
 
 		 398 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  26.37 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25.9 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  26.1 
 
 		 411 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  26.37 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  26.1 
 
 		 411 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 411 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.76 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.76 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  26.3 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.48 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  25.82 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.2 
 
 		 396 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 435 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 435 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.07 
 
 		 431 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.07 
 
 		 431 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 410 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 410 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 405 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.07 
 
 		 447 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.07 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.07 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  23.04 
 
 		 433 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  21.56 
 
 		 374 aa  94.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 407 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.01 
 
 		 383 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 428 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  26.06 
 
 		 414 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 367 aa  92  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  25 
 
 		 394 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  25 
 
 		 394 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.86 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.86 
 
 		 398 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  21.39 
 
 		 385 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.49 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.08 
 
 		 398 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.57 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 407 aa  88.2  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.75 
 
 		 394 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.57 
 
 		 398 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 444 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.17 
 
 		 438 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  20.9 
 
 		 385 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  20.9 
 
 		 385 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  20.9 
 
 		 385 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  20.9 
 
 		 385 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  20.9 
 
 		 385 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  22.42 
 
 		 402 aa  87  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 393 aa  87  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  20.86 
 
 		 385 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  21.12 
 
 		 385 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  21.43 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.45 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.05 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.05 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  20.37 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 397 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  30.68 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  19.14 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  19.36 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  30.61 
 
 		 918 aa  70.5  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  21.67 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  21.49 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.59 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  17.83 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  21.26 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  19.76 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  21.73 
 
 		 366 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  24.64 
 
 		 723 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 346 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  33.95 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  31.03 
 
 		 477 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 781 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  28.72 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>