28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1708 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1708  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 59 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2495  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0137298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2440  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  40.68 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  30.19 
 
 		 578 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  43.4 
 
 		 427 aa  48.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0209  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.841692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 481 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  48 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0734  phage shock protein C, putative  40.68 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  38.98 
 
 		 515 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0768  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 72 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000435177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 458 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3098  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215712  hitchhiker  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2939  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788518  normal  0.0375672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0808  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0603929  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0801  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0620019  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0776  phage shock protein C, PspC  40.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0944967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03594  phage shock protein C  32.76 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  47.73 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  43.4 
 
 		 440 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>