More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1704 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1704  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 465 aa  903    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2328  amino acid permease-associated region  79.05 
 
 		 467 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal  0.251139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2649  amino acid permease-associated region  79 
 
 		 467 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.925431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2372  amino acid permease-associated region  79.65 
 
 		 467 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  65.82 
 
 		 475 aa  578  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  66.88 
 
 		 543 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  63.79 
 
 		 480 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  63.79 
 
 		 480 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4411  amino acid permease-associated region  69.37 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528194  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  60.39 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  44.47 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  44.88 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  43.1 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  43.1 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  43.1 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  43.1 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  43.1 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  43.1 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  42.89 
 
 		 471 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1252  amino acid permease-associated region  46.02 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  44.3 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  44.47 
 
 		 494 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  44.09 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  44.09 
 
 		 467 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 471 aa  358  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  42.03 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  43.87 
 
 		 467 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  44.09 
 
 		 467 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  42.37 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  44.09 
 
 		 467 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  42.37 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  42.37 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  42.03 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  44.3 
 
 		 467 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  45.68 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  43.28 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  43.87 
 
 		 467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2384  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 518 aa  352  8.999999999999999e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.402999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  44.47 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  44.37 
 
 		 463 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  44.9 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  43.44 
 
 		 467 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  42.37 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2567  amino acid permease-associated region  47.68 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  41.72 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  43.66 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  42.15 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  41.94 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  43.92 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.81 
 
 		 471 aa  346  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  43.71 
 
 		 466 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 476 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  43.71 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  45.13 
 
 		 465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  43.71 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  43.71 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  43.71 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  41.94 
 
 		 471 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  44.33 
 
 		 466 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  41.8 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  44.11 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  43.8 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  44.11 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  43.9 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  43.68 
 
 		 471 aa  336  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  39.57 
 
 		 471 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  42.18 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  43.52 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  44.56 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  44.56 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  44.56 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  40.72 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  40.82 
 
 		 486 aa  333  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  43.95 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  44.35 
 
 		 467 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  44.35 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  44.35 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  44.35 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  44.35 
 
 		 467 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  43.71 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  41.31 
 
 		 494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 549 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  43.95 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  43.59 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  41.36 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  44.02 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  46.32 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  43.74 
 
 		 538 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 468 aa  319  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  39.58 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  40.62 
 
 		 480 aa  317  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  41.59 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  39.17 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  38.75 
 
 		 483 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  43.42 
 
 		 495 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  40.72 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  38.54 
 
 		 496 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>