135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1588 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1588  IS431mec-like transposase  100 
 
 		 140 aa  292  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.363136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  100 
 
 		 224 aa  266  8e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 224 aa  266  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  100 
 
 		 224 aa  266  8e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  100 
 
 		 224 aa  266  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 224 aa  265  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  100 
 
 		 224 aa  265  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  99.21 
 
 		 224 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  99.21 
 
 		 224 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  97.64 
 
 		 208 aa  263  7e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  98.43 
 
 		 224 aa  261  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  97.64 
 
 		 224 aa  259  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  97.64 
 
 		 224 aa  259  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  97.64 
 
 		 224 aa  259  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  97.64 
 
 		 224 aa  259  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  93.86 
 
 		 214 aa  225  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  88.68 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  53.6 
 
 		 226 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  52.8 
 
 		 226 aa  137  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  52.8 
 
 		 226 aa  137  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  52.8 
 
 		 226 aa  137  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  52.8 
 
 		 226 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  52.8 
 
 		 226 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  52.8 
 
 		 226 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  52.38 
 
 		 226 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  52 
 
 		 226 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  52 
 
 		 226 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  52 
 
 		 226 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  52 
 
 		 226 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  53.17 
 
 		 226 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  52 
 
 		 226 aa  133  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  50.4 
 
 		 236 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  59.57 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  35.11 
 
 		 302 aa  62  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  35.11 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  37.62 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 264 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  36.84 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  36.84 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  33.33 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  30 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  35.09 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  33.59 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  33.85 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  33.04 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  31.25 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  33.08 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  32.74 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  32.06 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  33.08 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  33.33 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  33.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  35.71 
 
 		 218 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  30.63 
 
 		 235 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.69 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  32.69 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  32.69 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.69 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  31.78 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  33.04 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  32.06 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  31.25 
 
 		 228 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  31.25 
 
 		 228 aa  52.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  35.29 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  35.29 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  33.64 
 
 		 212 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  33.64 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  32.43 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  31.48 
 
 		 341 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  28.46 
 
 		 222 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  31.48 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  32.14 
 
 		 236 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  34.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  29.77 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  30.36 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  29.77 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  29.77 
 
 		 236 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>