More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1401 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  100 
 
 
429 aa  880    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0453  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.09 
 
 
432 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0586  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.86 
 
 
434 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1918  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  90.21 
 
 
429 aa  778    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.63 
 
 
434 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0442  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.63 
 
 
434 aa  643    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  71.03 
 
 
428 aa  643    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0438  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.33 
 
 
432 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0536  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.86 
 
 
432 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0531  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.63 
 
 
434 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1952  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  90.21 
 
 
429 aa  778    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4790  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.86 
 
 
434 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.302308  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0587  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  70.09 
 
 
434 aa  646    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0514  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.63 
 
 
434 aa  643    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0101623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0485  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  72.26 
 
 
431 aa  656    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0447  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  69.86 
 
 
432 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2040  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.51 
 
 
433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.108556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  49.41 
 
 
430 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  51.89 
 
 
431 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.58 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  51.82 
 
 
430 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  49.64 
 
 
432 aa  435  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.15 
 
 
433 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.15 
 
 
433 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.22 
 
 
427 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.69 
 
 
434 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  49.51 
 
 
437 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.07 
 
 
432 aa  430  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48 
 
 
432 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.73 
 
 
432 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.96 
 
 
432 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1835  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48 
 
 
435 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0285  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.41 
 
 
430 aa  425  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1258  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  48.94 
 
 
430 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.535186  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  49.18 
 
 
432 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.96 
 
 
428 aa  428  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.37 
 
 
426 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.5 
 
 
427 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  44.58 
 
 
425 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.2 
 
 
433 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.37 
 
 
426 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.47 
 
 
433 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.9 
 
 
428 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.03 
 
 
428 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.34 
 
 
432 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.41 
 
 
430 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0645  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.24 
 
 
453 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.47 
 
 
433 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.53 
 
 
438 aa  425  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.79 
 
 
428 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.85 
 
 
432 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.2 
 
 
429 aa  418  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.9 
 
 
426 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.09 
 
 
428 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05471  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.72 
 
 
413 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.158139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.09 
 
 
428 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.86 
 
 
432 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  46.46 
 
 
439 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.06 
 
 
428 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.33 
 
 
430 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.9 
 
 
431 aa  419  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.96 
 
 
428 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.56 
 
 
427 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.9 
 
 
426 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  47.76 
 
 
452 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.09 
 
 
430 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.6 
 
 
429 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4629  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.63 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.09 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0161  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.45 
 
 
433 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.67 
 
 
426 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.86 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.63 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.88 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  46.84 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.13 
 
 
429 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.92 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.86 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.86 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  46.85 
 
 
433 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.86 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.43 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  47.72 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  45.54 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.43 
 
 
426 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.36 
 
 
429 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.36 
 
 
429 aa  415  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  44.5 
 
 
428 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  45.56 
 
 
427 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.36 
 
 
429 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.13 
 
 
428 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  48.36 
 
 
429 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>