More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1608 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  100 
 
 
433 aa  879    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.73 
 
 
427 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.61 
 
 
428 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.91 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.78 
 
 
427 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.02 
 
 
427 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.05 
 
 
626 aa  531  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.18 
 
 
428 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  60.96 
 
 
432 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.14 
 
 
428 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  62.44 
 
 
432 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.71 
 
 
427 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.85 
 
 
427 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  59.71 
 
 
430 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1545  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.49 
 
 
427 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  58.67 
 
 
437 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  58.18 
 
 
431 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.1 
 
 
429 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.78 
 
 
427 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.94 
 
 
430 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
430 aa  501  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1131  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  53.95 
 
 
430 aa  501  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.856626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1239  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  59.56 
 
 
426 aa  502  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.14 
 
 
430 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.94 
 
 
430 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.6 
 
 
428 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.42 
 
 
426 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
430 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.81 
 
 
432 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
430 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
430 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1258  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.24 
 
 
430 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.535186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.44 
 
 
433 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.47 
 
 
430 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2980  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.16 
 
 
428 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.823832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.71 
 
 
430 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
428 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0839  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.94 
 
 
427 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
430 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
427 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.67 
 
 
428 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.71 
 
 
427 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4552  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.92 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4194  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.68 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4205  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.68 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09260  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.38 
 
 
429 aa  491  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4548  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.68 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4947  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.71 
 
 
427 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4597  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.68 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.41 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.21 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0655  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.44 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4579  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.44 
 
 
429 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  57.08 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.84 
 
 
426 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.02 
 
 
444 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.6 
 
 
426 aa  490  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4358  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.44 
 
 
429 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4306  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.44 
 
 
429 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.29 
 
 
427 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.95 
 
 
428 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.94 
 
 
426 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.04 
 
 
422 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4693  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.44 
 
 
429 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.79 
 
 
444 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3177  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.19 
 
 
429 aa  490  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0806  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  60.24 
 
 
429 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0636  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56 
 
 
427 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0564968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4784  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.76 
 
 
427 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0445996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56 
 
 
426 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.24 
 
 
426 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4660  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56 
 
 
427 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333765  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.01 
 
 
426 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
426 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
426 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2033  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.48 
 
 
434 aa  484  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.37 
 
 
426 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3003  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.59 
 
 
422 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0218  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  58.51 
 
 
423 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.44 
 
 
428 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  56.04 
 
 
422 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4838  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.53 
 
 
427 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.53 
 
 
426 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3774  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.14 
 
 
429 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0848252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  57.01 
 
 
437 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.47 
 
 
426 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1753  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  57.08 
 
 
427 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.719453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  59.67 
 
 
439 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  55.5 
 
 
431 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  56.16 
 
 
438 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3551  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  54.78 
 
 
429 aa  481  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  54.82 
 
 
427 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1148  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  55.61 
 
 
430 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363924  hitchhiker  0.00958711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  57.21 
 
 
429 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>