More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1327 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1327  sensor histidine kinase  100 
 
 
409 aa  837    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0088456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
415 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000404489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0711  Signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.890851  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23920  histidine kinase  34.96 
 
 
412 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000513114  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  35.25 
 
 
408 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  29.68 
 
 
434 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  25.06 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  31.48 
 
 
430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  28.4 
 
 
400 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  32.38 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.3 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  25.81 
 
 
425 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  30.88 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
529 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  30.61 
 
 
455 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  22.25 
 
 
416 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1791  sensor histidine kinase  21.52 
 
 
395 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  21.68 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  25.28 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  28 
 
 
458 aa  95.9  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  25.54 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0984  sensor histidine kinase CiaH  27.43 
 
 
437 aa  94  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.805926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  29.41 
 
 
520 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  30.99 
 
 
584 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.44 
 
 
481 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  25.45 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
457 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  25.45 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  25.45 
 
 
392 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  25.45 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  25.76 
 
 
416 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
432 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
469 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
487 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
377 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  28.57 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  31.78 
 
 
551 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  27.66 
 
 
559 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
458 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  24.78 
 
 
412 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
524 aa  87  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  24.82 
 
 
429 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  31.37 
 
 
542 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1844  Signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.5 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  28.77 
 
 
501 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  26.45 
 
 
506 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
523 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  26.29 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
608 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0588  Signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
479 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  27.88 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.36 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
592 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
581 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  27.75 
 
 
504 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  28.23 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  27.98 
 
 
508 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1216  histidine kinase  29.61 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
389 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  26.71 
 
 
527 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
532 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.12 
 
 
486 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
532 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
517 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  27.62 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
596 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>