45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0273 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1088    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  50.53 
 
 		 566 aa  548  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  56.91 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  47.11 
 
 		 570 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  48.57 
 
 		 581 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  50.44 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  49.13 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  49.31 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  45.09 
 
 		 573 aa  485  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  52.05 
 
 		 582 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  47.99 
 
 		 568 aa  478  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  48.34 
 
 		 569 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  47.29 
 
 		 570 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  47.62 
 
 		 570 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  45 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  45.76 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  43.21 
 
 		 567 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  49.11 
 
 		 582 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  46.76 
 
 		 568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  46.61 
 
 		 564 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  49.12 
 
 		 583 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  47.36 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  41.52 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  41.31 
 
 		 551 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  40.67 
 
 		 548 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  40.57 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  45.57 
 
 		 556 aa  347  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  41.61 
 
 		 563 aa  313  6.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  36.77 
 
 		 615 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  48.32 
 
 		 699 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  31.62 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  32.3 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  34.46 
 
 		 456 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  29.41 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.36 
 
 		 339 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755562  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  29.27 
 
 		 659 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  30.71 
 
 		 592 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  26.56 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  29.91 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  29.92 
 
 		 592 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  29.92 
 
 		 592 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  33.62 
 
 		 374 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0985  ABC transporter related protein  28.44 
 
 		 607 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.674675  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  29.52 
 
 		 615 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  35.42 
 
 		 244 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>