33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0727 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  66.79 
 
 		 548 aa  784    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1139    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  78.1 
 
 		 551 aa  920    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  76.82 
 
 		 551 aa  905    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  52.18 
 
 		 553 aa  542  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  42.32 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  44.29 
 
 		 568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  44.29 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  43.06 
 
 		 570 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  43.21 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  40.3 
 
 		 609 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  41.19 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  42.17 
 
 		 567 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  40.25 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  41.74 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  43.19 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  41.95 
 
 		 573 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  41.42 
 
 		 567 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  42.66 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  39.72 
 
 		 581 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  40.91 
 
 		 582 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  41.28 
 
 		 582 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  41.08 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  41.19 
 
 		 568 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  41.62 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  40.9 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  39.39 
 
 		 556 aa  309  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  37.64 
 
 		 563 aa  267  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  37.83 
 
 		 615 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  44.79 
 
 		 699 aa  196  7e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  28.62 
 
 		 459 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  29.3 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  29.73 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.108492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>