38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0925 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1153    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  71.76 
 
 
583 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  46.3 
 
 
566 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  44.89 
 
 
581 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  49.12 
 
 
568 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  50.44 
 
 
582 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  46.37 
 
 
568 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  46.55 
 
 
568 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  43.64 
 
 
567 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  43.96 
 
 
573 aa  467  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  55.17 
 
 
556 aa  463  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  45.07 
 
 
570 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  46.9 
 
 
570 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  44.17 
 
 
567 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  48.58 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  48.16 
 
 
570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  42.86 
 
 
609 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  45.73 
 
 
569 aa  444  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  49.11 
 
 
564 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  44.46 
 
 
568 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  48.19 
 
 
553 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  44.68 
 
 
570 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  44.37 
 
 
570 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  42.44 
 
 
548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  40.91 
 
 
549 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  40.69 
 
 
551 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  40.65 
 
 
551 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  39.67 
 
 
563 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  36.54 
 
 
615 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  44.44 
 
 
699 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  37.25 
 
 
456 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  33.33 
 
 
459 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  37.56 
 
 
469 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  26.23 
 
 
285 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  33.86 
 
 
765 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18010  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  27.08 
 
 
568 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2345  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.67 
 
 
348 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1512  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  28.67 
 
 
348 aa  45.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>