33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0593 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  67.34 
 
 
551 aa  784    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  66.79 
 
 
549 aa  784    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  66.79 
 
 
551 aa  779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  100 
 
 
548 aa  1139    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  52.01 
 
 
553 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  44.11 
 
 
567 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  43.66 
 
 
570 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  42.17 
 
 
566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  42.33 
 
 
570 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  43.84 
 
 
568 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  43.58 
 
 
568 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  40.43 
 
 
609 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  42.28 
 
 
567 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  43.23 
 
 
570 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  42.03 
 
 
573 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  42.05 
 
 
581 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  42.88 
 
 
570 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  43.08 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  41.14 
 
 
569 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  42.44 
 
 
582 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  43.24 
 
 
564 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  40.67 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  41.75 
 
 
582 aa  393  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  41.79 
 
 
583 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  41.27 
 
 
570 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  40 
 
 
568 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  37.43 
 
 
556 aa  310  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  37.89 
 
 
563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  37.36 
 
 
615 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  41.53 
 
 
699 aa  206  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  30.1 
 
 
459 aa  99.4  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  32.54 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  28.06 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.108492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>