34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2476 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1153    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  54.34 
 
 		 568 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  54.34 
 
 		 568 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  52.49 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  51.05 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  50 
 
 		 609 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  50.17 
 
 		 581 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  56.72 
 
 		 570 aa  554  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  48.67 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  53.68 
 
 		 568 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  50.44 
 
 		 570 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  49.56 
 
 		 568 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  50.09 
 
 		 570 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  44.39 
 
 		 573 aa  484  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  50.44 
 
 		 582 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  50.09 
 
 		 570 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  45.2 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  50.26 
 
 		 564 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  51.87 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  47.49 
 
 		 569 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  49.12 
 
 		 583 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  48.94 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  40.81 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  40.11 
 
 		 551 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  41.75 
 
 		 548 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  41.28 
 
 		 549 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  48.62 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  40.89 
 
 		 563 aa  323  4e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  39.78 
 
 		 615 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  46.5 
 
 		 699 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  40.1 
 
 		 456 aa  97.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  37.1 
 
 		 459 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  37.7 
 
 		 469 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.33 
 
 		 353 aa  44.3  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>