33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1915 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  915    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  43.43 
 
 
469 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  37.18 
 
 
459 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  31.9 
 
 
569 aa  106  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  37.25 
 
 
582 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  31.42 
 
 
581 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  40.1 
 
 
582 aa  97.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  32.96 
 
 
570 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  34.46 
 
 
561 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  34.25 
 
 
564 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  36.22 
 
 
566 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  28.84 
 
 
567 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  37.89 
 
 
568 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  30.11 
 
 
570 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  33.08 
 
 
583 aa  87.4  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  29.79 
 
 
609 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  28.52 
 
 
573 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  32.91 
 
 
570 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  29.18 
 
 
568 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  30.47 
 
 
568 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  30.47 
 
 
568 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  31.45 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  29.89 
 
 
570 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  28.06 
 
 
548 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  31.5 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  29.73 
 
 
549 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  32.17 
 
 
570 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  27.37 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  31.72 
 
 
556 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  27.61 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  29.53 
 
 
615 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  29.8 
 
 
563 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  29.44 
 
 
699 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>