33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2333 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  100 
 
 		 567 aa  1165    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  51.57 
 
 		 570 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  52.03 
 
 		 573 aa  596  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  49.91 
 
 		 566 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  50.26 
 
 		 570 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  48.43 
 
 		 581 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  50.18 
 
 		 568 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  50.18 
 
 		 568 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  46.73 
 
 		 564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  49.64 
 
 		 567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  46.49 
 
 		 570 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  47.8 
 
 		 568 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  46.22 
 
 		 570 aa  498  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  46.47 
 
 		 569 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  43.86 
 
 		 609 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  45.2 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  43.64 
 
 		 582 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  43.21 
 
 		 561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  44.74 
 
 		 570 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  44.08 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  41.5 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  42.81 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  42.28 
 
 		 548 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  41.62 
 
 		 551 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  41.49 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  41.42 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  38.91 
 
 		 556 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  40.22 
 
 		 563 aa  329  8e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  45.97 
 
 		 615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  43.17 
 
 		 699 aa  231  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  31.28 
 
 		 469 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  28.62 
 
 		 459 aa  91.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  31.5 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.108492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>