33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0524 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  100 
 
 
569 aa  1145    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  51.15 
 
 
570 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  46.37 
 
 
566 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  45.63 
 
 
567 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  46.47 
 
 
567 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  47.73 
 
 
568 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  47.55 
 
 
568 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  49.11 
 
 
564 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  48.78 
 
 
570 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  44.84 
 
 
609 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  43.18 
 
 
573 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  45.63 
 
 
570 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  44.23 
 
 
581 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  47.4 
 
 
568 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  47.99 
 
 
561 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  47.49 
 
 
582 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  46.74 
 
 
570 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  45.73 
 
 
582 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  46.83 
 
 
553 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  44.29 
 
 
568 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  43.13 
 
 
570 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  45.21 
 
 
583 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  40.25 
 
 
549 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  41.14 
 
 
548 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  39.68 
 
 
551 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.86 
 
 
551 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  43.33 
 
 
556 aa  330  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  39.78 
 
 
563 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  37.42 
 
 
615 aa  257  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  43.52 
 
 
699 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  31.9 
 
 
456 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  32.44 
 
 
469 aa  98.2  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  32.5 
 
 
459 aa  90.5  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>