34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3562 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  76.15 
 
 
567 aa  913    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  100 
 
 
568 aa  1158    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  63.16 
 
 
609 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  59.82 
 
 
570 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  99.47 
 
 
568 aa  1151    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  54.39 
 
 
570 aa  621  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  54.96 
 
 
566 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  54.04 
 
 
581 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  54.34 
 
 
582 aa  591  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  55.87 
 
 
570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  49.13 
 
 
573 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  51.77 
 
 
568 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  52.14 
 
 
568 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  50.8 
 
 
570 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  50.18 
 
 
567 aa  525  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  47.73 
 
 
569 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  47.12 
 
 
570 aa  498  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  49.13 
 
 
561 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  46.55 
 
 
582 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  49.82 
 
 
553 aa  474  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  46.62 
 
 
583 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  46.63 
 
 
564 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  44.29 
 
 
549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  43.63 
 
 
551 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  43.58 
 
 
548 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  42.63 
 
 
551 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  41.86 
 
 
556 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  41.74 
 
 
563 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  44.35 
 
 
615 aa  269  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  34.09 
 
 
699 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  30.58 
 
 
469 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  33.33 
 
 
459 aa  96.3  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  30.47 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  23.68 
 
 
312 aa  45.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>