33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43550 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  100 
 
 
563 aa  1158    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  45.34 
 
 
566 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  41.8 
 
 
581 aa  353  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  42.61 
 
 
568 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  43.85 
 
 
570 aa  351  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  42.61 
 
 
568 aa  351  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  42.67 
 
 
570 aa  349  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  40.49 
 
 
567 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  41.52 
 
 
573 aa  342  8e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  40.7 
 
 
609 aa  339  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  40.44 
 
 
567 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  43.5 
 
 
568 aa  329  7e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  41.72 
 
 
570 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  40.3 
 
 
582 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  40.49 
 
 
568 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  41.16 
 
 
570 aa  319  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  41.99 
 
 
561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  40.77 
 
 
570 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  39.36 
 
 
582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  41.8 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  40.63 
 
 
564 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  43.21 
 
 
583 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  40.44 
 
 
569 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  38.12 
 
 
548 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  39.55 
 
 
551 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  39.55 
 
 
551 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  37.87 
 
 
549 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  40.04 
 
 
556 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  40.78 
 
 
615 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  36.02 
 
 
699 aa  164  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  29.8 
 
 
456 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  27.31 
 
 
459 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  30.43 
 
 
469 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>