More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6088 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6088  ABC transporter related  100 
 
 		 521 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3093  ABC transporter related  49.19 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.193565  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.12 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  40.4 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.94 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.89 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  40.99 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.33 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.55 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.62 
 
 		 496 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  39.27 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  40.4 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  38.79 
 
 		 492 aa  359  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 494 aa  359  8e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.49 
 
 		 513 aa  359  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 494 aa  356  5e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  40.4 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.04 
 
 		 523 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  39.68 
 
 		 525 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.29 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.13 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.99 
 
 		 499 aa  349  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  39.39 
 
 		 501 aa  349  8e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 504 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  40.83 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  40.45 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  37.3 
 
 		 505 aa  348  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.41 
 
 		 499 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.03 
 
 		 517 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.88 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  40.16 
 
 		 513 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  37.93 
 
 		 496 aa  347  4e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  38.27 
 
 		 505 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 525 aa  346  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  39.55 
 
 		 501 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  40.16 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.84 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.31 
 
 		 501 aa  345  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.51 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.13 
 
 		 503 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  39.27 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  40.2 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  39.24 
 
 		 501 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.16 
 
 		 512 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.16 
 
 		 512 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  41.58 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 515 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 515 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  37.42 
 
 		 500 aa  342  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  39.07 
 
 		 509 aa  342  9e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  39.64 
 
 		 499 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.96 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  38.66 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.53 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.65 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  39.64 
 
 		 499 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.92 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.87 
 
 		 514 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  41.53 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  38.38 
 
 		 501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  38.22 
 
 		 499 aa  340  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.52 
 
 		 514 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  38.17 
 
 		 516 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 501 aa  339  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 501 aa  339  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  41.12 
 
 		 500 aa  339  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.48 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  39.26 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  38.26 
 
 		 501 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.4 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  36.25 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  39.67 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  37.45 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  37.45 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  39.67 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  37.45 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.06 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  37.85 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>