34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3034 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  731    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  88.09 
 
 		 361 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  48.91 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  27.84 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  28.77 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  27.57 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  32.11 
 
 		 379 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  28.07 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  30.45 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  27.81 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  26.68 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  25.61 
 
 		 388 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  29.97 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  56.57 
 
 		 466 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  26.15 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  25.41 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  22.08 
 
 		 389 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  27.54 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  27.45 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  26.83 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  27.17 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  26.49 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  21.12 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  26.17 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  22.07 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  22.79 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  23.16 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  24.2 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  24.2 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  24.93 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  20.69 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  23.8 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  24.45 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  24.54 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>