33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0154 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  785    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  62.2 
 
 
381 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  47.4 
 
 
383 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  47.68 
 
 
387 aa  324  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  44.78 
 
 
382 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  29.84 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  30.47 
 
 
389 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  31.2 
 
 
387 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  30.11 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  29.2 
 
 
389 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  24.8 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  28.1 
 
 
371 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  27.25 
 
 
397 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  30.11 
 
 
364 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  30.43 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  29.49 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  26.32 
 
 
390 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  28.07 
 
 
361 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  28.85 
 
 
365 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  27.1 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  26.94 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  28.57 
 
 
365 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  26.83 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  29.19 
 
 
367 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  26.09 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  27.19 
 
 
371 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  26.93 
 
 
370 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  27.17 
 
 
409 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  25.2 
 
 
370 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  26.39 
 
 
370 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  23.37 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  27.4 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  20.58 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>