31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1307 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  783    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  82.22 
 
 
409 aa  646    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  31.78 
 
 
389 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  30.85 
 
 
388 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  33.16 
 
 
388 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  33.76 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  27.44 
 
 
485 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  24.54 
 
 
397 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  26.67 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  27.72 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  28.02 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  26.94 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  27.45 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  26.13 
 
 
383 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  26.56 
 
 
381 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  26.94 
 
 
383 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  26.25 
 
 
387 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  24.35 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  29.61 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  23.62 
 
 
373 aa  87  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  25.71 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  24.1 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  23.59 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  23.21 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  23.16 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  27.78 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  27.81 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  33.54 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  21.53 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  21.75 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  21.01 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>