35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0912 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  99.73 
 
 		 372 aa  741    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  742    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  50.94 
 
 		 373 aa  359  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  45.68 
 
 		 371 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  45.95 
 
 		 373 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  38.07 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  27.94 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  30.67 
 
 		 389 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  29.34 
 
 		 388 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  29.73 
 
 		 387 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  27.72 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  27.1 
 
 		 381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  27.86 
 
 		 409 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  28.26 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  25.07 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  27.15 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  23.2 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  26.33 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  26.42 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  28.69 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  24.48 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  26.88 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  27.08 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  25 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  24.5 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  23.28 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  24.03 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0444  hypothetical protein  39.51 
 
 		 95 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00689479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  25.13 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0445  hypothetical protein  32.3 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00422073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  25.63 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  25.14 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  27.18 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  23.78 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>