31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6492 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  1016    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  42.89 
 
 
397 aa  340  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  36.46 
 
 
387 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  33.95 
 
 
389 aa  213  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  31.76 
 
 
388 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  31.17 
 
 
390 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  27.44 
 
 
388 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  24.75 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  24.8 
 
 
381 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  26.23 
 
 
382 aa  133  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  23.02 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  25.97 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  26.19 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  24.87 
 
 
371 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  25.13 
 
 
387 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  23.72 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  23.2 
 
 
372 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  23.2 
 
 
372 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  22.28 
 
 
389 aa  87  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  22.28 
 
 
373 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  21.12 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  19.85 
 
 
361 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  21.25 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  21.38 
 
 
371 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  20.69 
 
 
364 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  19.67 
 
 
365 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  19.67 
 
 
365 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  19.79 
 
 
370 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  19.44 
 
 
370 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  22.89 
 
 
367 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>