31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2164 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  787    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  50.53 
 
 
381 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  47.68 
 
 
381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  46.6 
 
 
383 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  43.04 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  30.59 
 
 
388 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  31.46 
 
 
387 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  29.41 
 
 
389 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  30.08 
 
 
388 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  28.84 
 
 
389 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  25.13 
 
 
485 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  25.82 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  29.37 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  26.29 
 
 
372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  26.86 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  26.03 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  24.42 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  27.03 
 
 
388 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  28.31 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  30.16 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  27.79 
 
 
361 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  27.54 
 
 
361 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  25.2 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  25.64 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  26.5 
 
 
371 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  26.21 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  24.8 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  25.78 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  24.75 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  23.54 
 
 
370 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  24.56 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>