33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4088 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  799    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  49.74 
 
 
388 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  47.04 
 
 
387 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  45.27 
 
 
389 aa  347  3e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  34.11 
 
 
390 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  31.76 
 
 
485 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  33.16 
 
 
388 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  30.97 
 
 
397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  34.02 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  30.11 
 
 
381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  29.01 
 
 
383 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  29.57 
 
 
381 aa  157  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  29.33 
 
 
383 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  28.31 
 
 
382 aa  153  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  29.34 
 
 
372 aa  149  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  29.08 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  29.85 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  28.01 
 
 
371 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  28.42 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  26.34 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  26.27 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  26.68 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  25.84 
 
 
370 aa  104  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  27.06 
 
 
365 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  27.3 
 
 
370 aa  103  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  27.76 
 
 
365 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  25.71 
 
 
370 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  28.17 
 
 
367 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  25.38 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  24.35 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  23.77 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  24.66 
 
 
374 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  21.53 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>