33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2092 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  45.95 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  45.95 
 
 
372 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  45.14 
 
 
373 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  38.48 
 
 
371 aa  259  7e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  35.01 
 
 
371 aa  182  9.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  30.97 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  28.21 
 
 
389 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  26.4 
 
 
383 aa  102  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  23.06 
 
 
388 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  24.81 
 
 
387 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  25.32 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  23.37 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  24.35 
 
 
388 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  25.2 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  23.98 
 
 
390 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  22.28 
 
 
485 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  27.91 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  23.39 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  26.17 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  25.71 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  29.26 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  27.22 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  21.5 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  23.63 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  31.45 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  29.6 
 
 
365 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  20.41 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0445  hypothetical protein  40.96 
 
 
130 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00422073  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  20.73 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  19.74 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  28.35 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  25.88 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>