35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4039 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  757    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  45.68 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  45.41 
 
 
372 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  40.97 
 
 
373 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  38.48 
 
 
373 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  32.08 
 
 
371 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  31.95 
 
 
387 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  28.1 
 
 
381 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  29.73 
 
 
389 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  26.52 
 
 
388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  28.01 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  28.05 
 
 
383 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  26.89 
 
 
383 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  27.25 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  28.02 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  24.87 
 
 
485 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  26.1 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  26.73 
 
 
390 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  24.74 
 
 
397 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  26.8 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  27.2 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  24.23 
 
 
370 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  25.14 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  24.8 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  26.49 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  26.09 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  20.92 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  20.17 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  25.21 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  25.2 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  24.8 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  22.4 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  22.97 
 
 
364 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  25.08 
 
 
391 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0444  hypothetical protein  46.15 
 
 
95 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00689479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>