31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1513 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  822    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  42.89 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  33.78 
 
 		 387 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  30.97 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  28.53 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  30.4 
 
 		 389 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  30.41 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  24.54 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  27.25 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  26.42 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  25.55 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  25.78 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  23.71 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  25.26 
 
 		 373 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  25.82 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  24.74 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  24.48 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  24.48 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  23.91 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  22.68 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  22.28 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  21.5 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  19.84 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  29.81 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  22.64 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  29.56 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  20.3 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  22.68 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  21.54 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  20.69 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  19.69 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>