30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1100 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  746    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  50.54 
 
 
361 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  48.91 
 
 
361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  30.21 
 
 
370 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  28.84 
 
 
370 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  28.3 
 
 
370 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  32.69 
 
 
379 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  30.11 
 
 
381 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  28.8 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  24.66 
 
 
383 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  25.38 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  23.93 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  23.47 
 
 
389 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  24.69 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  26.33 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  23.96 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  24.73 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  25.98 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  25.07 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  41.84 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  19.84 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  26.12 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  20.69 
 
 
485 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  22.08 
 
 
383 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  21.35 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  22.97 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  23.78 
 
 
372 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  23.78 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  21.75 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  21.2 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>