15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4586 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  31.17 
 
 
361 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  30.45 
 
 
361 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  23.37 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  24.94 
 
 
364 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  22.84 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  21.57 
 
 
370 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  24.18 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  25.51 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  20.71 
 
 
381 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  20.48 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  20.4 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  20.81 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  27.55 
 
 
466 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  24.24 
 
 
373 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>