32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2239 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  765    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  74.59 
 
 		 370 aa  594  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  74.32 
 
 		 370 aa  596  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  30.49 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  30.21 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  28.77 
 
 		 361 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  28.07 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  28.45 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  25.71 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  25.2 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  23.9 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  22.94 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  24.23 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4586  hypothetical protein  24.08 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48591  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0329  hypothetical protein  25.47 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  24.14 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  22.92 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  23.28 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  23.21 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  23.28 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  20.72 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  24.5 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  21.25 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  20.81 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  20.3 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  37 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  20.73 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  22.47 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  21.02 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  21.41 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  22.37 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  26.33 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>