32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1846 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 390 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  34.11 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  31.17 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  32.38 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  30.08 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  30.41 
 
 		 397 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  28.04 
 
 		 389 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  26.77 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  26.67 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  28.76 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  24.55 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  26.32 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  25.95 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  24.22 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  25.07 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  25.07 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  23.9 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  26.73 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  23.66 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  23.98 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  23.79 
 
 		 371 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  22.61 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  22.07 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  22.5 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  22.12 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  24.47 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  22.81 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  21.35 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  22.31 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  21.02 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  20.67 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  20.72 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>