35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1169 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  737    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  50.94 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  50.67 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  45.14 
 
 		 373 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  40.97 
 
 		 371 aa  276  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  34.22 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  26.34 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6492  hypothetical protein  26.19 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  26.09 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  26.23 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1513  hypothetical protein  25.26 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  24.61 
 
 		 389 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2216  hypothetical protein  23.44 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160171 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2239  hypothetical protein  28.45 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  27.3 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  23.66 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  24.47 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0109  hypothetical protein  27.42 
 
 		 382 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0079  hypothetical protein  25.39 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3034  hypothetical protein  26.83 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2164  hypothetical protein  25.64 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0085  hypothetical protein  24.74 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  23.62 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1786  hypothetical protein  25.33 
 
 		 383 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  24.16 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2060  hypothetical protein  26.39 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1718  hypothetical protein  24.93 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.473614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0444  hypothetical protein  45.68 
 
 		 95 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00689479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0445  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00422073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3834  hypothetical protein  25.98 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.221085  normal  0.0370464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1100  hypothetical protein  21.2 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4277  hypothetical protein  27.33 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4255  hypothetical protein  27 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4124  hypothetical protein  26 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173998  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.76 
 
 		 1992 aa  42.7  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>