136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1405 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2201  chromosome partitioning ATPase  91.06 
 
 		 416 aa  764    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1405  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 416 aa  826    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1733  chromosome partitioning ATPase  43.07 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.635765 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0002  hypothetical protein  25.69 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00393773  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6108  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.99 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  25.95 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  25.95 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4544  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.23 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.46 
 
 		 294 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.88 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 		 253 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.143789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 		 273 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  30.86 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  31.21 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  32.08 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 		 263 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 263 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 		 343 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.82 
 
 		 295 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 295 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  29.21 
 
 		 309 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  24.58 
 
 		 455 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1718  hypothetical protein  28.48 
 
 		 310 aa  50.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.21 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  28.19 
 
 		 275 aa  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 		 278 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  30.5 
 
 		 745 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.33 
 
 		 278 aa  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 		 311 aa  49.7  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  30.5 
 
 		 745 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.32 
 
 		 480 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.06 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.07 
 
 		 735 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  31.43 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.11 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.56 
 
 		 288 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3375  chromosome partitioning protein  33.58 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  28.05 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  25.13 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  27.68 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  23.6 
 
 		 262 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.56 
 
 		 734 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2055  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  28.75 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.71 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  26.88 
 
 		 745 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  25.6 
 
 		 253 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  29.74 
 
 		 266 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  29.93 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 		 257 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0363  ATP-binding protein  27.41 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  22.44 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  29.28 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4704  hypothetical protein  25.43 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.155939  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.82 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  29.02 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 257 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1985  nucleotide-binding protein  30.37 
 
 		 282 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2274  ParA family protein  31.65 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0350  cell division ATPase MinD  30 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0402773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.93 
 
 		 330 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  25.61 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.94 
 
 		 800 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0605  hypothetical protein  29.41 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  27.78 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  29.93 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1885  CODH nickel-insertion accessory protein  46.15 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.63 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.5 
 
 		 746 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  28.37 
 
 		 746 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 		 303 aa  44.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  26.32 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  30.71 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  28.37 
 
 		 746 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  28.37 
 
 		 746 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.3 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  27.35 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.13 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1084  hypothetical protein  29.01 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0044  hypothetical protein  27.78 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 275 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0348907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>