More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0755 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5304  xanthine/uracil/vitamin C permease  81.7 
 
 		 462 aa  714    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.51043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4851  xanthine/uracil/vitamin C permease  81.03 
 
 		 462 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0755  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  882    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.364664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1523  Xanthine/uracil/vitamin C permease  79.2 
 
 		 460 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.322719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0705  Xanthine/uracil/vitamin C permease  87.17 
 
 		 460 aa  765    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4989  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  87.61 
 
 		 460 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  81.03 
 
 		 462 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867027  normal  0.02261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0234  xanthine/uracil/vitamin C transporter  80.58 
 
 		 462 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2951  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  80.75 
 
 		 460 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4934  putative Xanthine/uracil/vitamin C permease  86.3 
 
 		 460 aa  755    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  0.938879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5444  xanthine/uracil/vitamin C permease  80.8 
 
 		 462 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0771  Xanthine/uracil/vitamin C permease  86.96 
 
 		 460 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4759  xanthine/uracil/vitamin C permease  81.7 
 
 		 462 aa  715    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.651751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1821  xanthine/uracil/vitamin C permease  82.57 
 
 		 465 aa  725    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779574  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5418  xanthine/uracil/vitamin C permease  80.8 
 
 		 462 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  decreased coverage  0.00408682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3264  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.93 
 
 		 455 aa  630  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.033306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3379  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.48 
 
 		 455 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000491987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4431  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.98 
 
 		 453 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.856106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02717  predicted transporter  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03936  predicted permease  69.7 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0175362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03896  hypothetical protein  69.7 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0267523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0808  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3928  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.7 
 
 		 449 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4307  sulfate permease family inorganic anion transporter  69.7 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4527  sulfate permease family inorganic anion transporter  69.93 
 
 		 449 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3963  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.7 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0269  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.25 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.373527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0824  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3017  sulfate permease family inorganic anion transporter  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5568  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  69.7 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4174  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3044  sulfate permease family inorganic anion transporter  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3210  sulfate permease family inorganic anion transporter  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02679  hypothetical protein  71.3 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.431343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4612  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  69.7 
 
 		 449 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.172522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4520  inorganic anion transporter sulfate permease (SulP) family  69.7 
 
 		 449 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4663  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  69.7 
 
 		 449 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0660  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.86 
 
 		 451 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.079445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4528  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  69.7 
 
 		 449 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4619  sulfate permease family inorganic anion transporter  69.48 
 
 		 449 aa  599  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.5445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4582  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  69.48 
 
 		 449 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4614  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  69.7 
 
 		 449 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0888  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.7 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0819794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0358  xanthine/uracil permease family protein  69.63 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1235  xanthine/uracil permease family protein  69.63 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0426  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.63 
 
 		 451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.22 
 
 		 450 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.65 
 
 		 450 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.22 
 
 		 450 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1157  Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.22 
 
 		 450 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3048  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.96 
 
 		 451 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1236  xanthine/uracil permease family protein  64.13 
 
 		 450 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3026  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.71 
 
 		 452 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2812  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.53 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1054  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.57 
 
 		 450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.35 
 
 		 450 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3356  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.54 
 
 		 476 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1058  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.13 
 
 		 450 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3523  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.3 
 
 		 458 aa  551  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2795  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.05 
 
 		 452 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0601  xanthine/uracil family permease  64.2 
 
 		 429 aa  531  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.474213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.72 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  42.03 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.88 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.82 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.3 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.88 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.94 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.65 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.65 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.18 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.65 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.94 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.89 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  40.89 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.71 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  40.65 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  38.77 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.3 
 
 		 445 aa  299  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  40.47 
 
 		 429 aa  299  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.34 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  40.89 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.81 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  40.42 
 
 		 431 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.87 
 
 		 430 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.59 
 
 		 445 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  41.05 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.24 
 
 		 429 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.42 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  39.33 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  39.33 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  40.23 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  39.33 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.42 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>