More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4527 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02717  predicted transporter  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03936  predicted permease  99.55 
 
 		 449 aa  857    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0175362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0808  Xanthine/uracil/vitamin C permease  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3928  Xanthine/uracil/vitamin C permease  99.33 
 
 		 449 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5568  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  99.55 
 
 		 449 aa  857    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4520  inorganic anion transporter sulfate permease (SulP) family  97.55 
 
 		 449 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4612  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  97.55 
 
 		 449 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.172522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3017  sulfate permease family inorganic anion transporter  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1235  xanthine/uracil permease family protein  85.04 
 
 		 451 aa  726    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207777 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02679  hypothetical protein  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.431343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.61 
 
 		 450 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3963  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.55 
 
 		 449 aa  857    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0660  Xanthine/uracil/vitamin C permease  83.26 
 
 		 451 aa  713    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.079445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1236  xanthine/uracil permease family protein  72.83 
 
 		 450 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2812  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.94 
 
 		 450 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.16 
 
 		 450 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3379  Xanthine/uracil/vitamin C permease  84.04 
 
 		 455 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000491987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0824  xanthine/uracil/vitamin C permease  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0358  xanthine/uracil permease family protein  85.04 
 
 		 451 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4528  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  97.55 
 
 		 449 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4307  sulfate permease family inorganic anion transporter  99.55 
 
 		 449 aa  857    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4614  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  97.55 
 
 		 449 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4619  sulfate permease family inorganic anion transporter  99.33 
 
 		 449 aa  856    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.5445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4663  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  97.55 
 
 		 449 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3044  sulfate permease family inorganic anion transporter  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0269  xanthine/uracil/vitamin C permease  94.43 
 
 		 449 aa  823    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.373527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4527  sulfate permease family inorganic anion transporter  100 
 
 		 449 aa  862    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4174  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3264  Xanthine/uracil/vitamin C permease  84.32 
 
 		 455 aa  734    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.033306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1157  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.61 
 
 		 450 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.61 
 
 		 450 aa  641    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0426  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.04 
 
 		 451 aa  726    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3210  sulfate permease family inorganic anion transporter  82.89 
 
 		 455 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03896  hypothetical protein  99.55 
 
 		 449 aa  857    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0267523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4431  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.55 
 
 		 453 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.856106 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4582  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  99.33 
 
 		 449 aa  855    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0888  Xanthine/uracil/vitamin C permease  83.37 
 
 		 455 aa  709    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0819794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1054  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.94 
 
 		 450 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0601  xanthine/uracil family permease  74.36 
 
 		 429 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.474213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.94 
 
 		 450 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3048  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.37 
 
 		 451 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1058  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.71 
 
 		 450 aa  624  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4989  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  72.21 
 
 		 460 aa  617  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4934  putative Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.97 
 
 		 460 aa  614  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  0.938879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3026  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.94 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0234  xanthine/uracil/vitamin C transporter  71.95 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0771  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.89 
 
 		 460 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4759  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.76 
 
 		 462 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.651751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5304  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.54 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.51043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0705  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.44 
 
 		 460 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2795  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.05 
 
 		 452 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5444  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.54 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654627  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4851  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.76 
 
 		 462 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5418  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.54 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  decreased coverage  0.00408682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0755  hypothetical protein  69.93 
 
 		 460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.364664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3356  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.37 
 
 		 476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.49 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867027  normal  0.02261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1523  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.68 
 
 		 460 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.322719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3523  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.6 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2951  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  70.23 
 
 		 460 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1821  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.73 
 
 		 465 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779574  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.6 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.6 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  40.6 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.6 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.6 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.6 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  40.6 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  40.6 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  38.28 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  40.19 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.19 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  39.95 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  42.69 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  41.44 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.44 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.59 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.17 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.17 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.13 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.06 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.82 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.06 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.76 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.82 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 		 431 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  39.39 
 
 		 449 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.46 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.57 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.2 
 
 		 441 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.47 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  39.39 
 
 		 449 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 		 431 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.76 
 
 		 431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.7 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 		 431 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.81 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>