More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4851 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0705  Xanthine/uracil/vitamin C permease  81.39 
 
 
460 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1523  Xanthine/uracil/vitamin C permease  84.85 
 
 
460 aa  758    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.322719  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0755  hypothetical protein  81.03 
 
 
460 aa  712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.364664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1821  xanthine/uracil/vitamin C permease  87.13 
 
 
465 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779574  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4851  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
462 aa  882    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571866  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4989  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  81.6 
 
 
460 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0771  Xanthine/uracil/vitamin C permease  81.17 
 
 
460 aa  712    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0234  xanthine/uracil/vitamin C transporter  96.97 
 
 
462 aa  859    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5304  xanthine/uracil/vitamin C permease  97.19 
 
 
462 aa  863    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.51043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  94.16 
 
 
462 aa  840    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867027  normal  0.02261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2951  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  84.85 
 
 
460 aa  758    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4934  putative Xanthine/uracil/vitamin C permease  81.82 
 
 
460 aa  716    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  0.938879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5444  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.78 
 
 
462 aa  881    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4759  xanthine/uracil/vitamin C permease  96.97 
 
 
462 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.651751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5418  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.78 
 
 
462 aa  881    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  decreased coverage  0.00408682 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3264  Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.47 
 
 
455 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.033306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3379  Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.41 
 
 
455 aa  624  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000491987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4431  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.24 
 
 
453 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.856106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03936  predicted permease  70.76 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0175362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3928  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.82 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0660  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.91 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.079445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4527  sulfate permease family inorganic anion transporter  70.76 
 
 
449 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03896  hypothetical protein  70.76 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0267523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5568  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  70.76 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4307  sulfate permease family inorganic anion transporter  70.76 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3963  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.76 
 
 
449 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0888  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.21 
 
 
455 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0819794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02717  predicted transporter  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0808  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0358  xanthine/uracil permease family protein  72.38 
 
 
451 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4612  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  70.31 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.172522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4582  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  70.54 
 
 
449 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0824  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1235  xanthine/uracil permease family protein  72.38 
 
 
451 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207777 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4619  sulfate permease family inorganic anion transporter  70.54 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.5445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4528  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  70.31 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0426  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.38 
 
 
451 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4174  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4663  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  70.31 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424808  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4614  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  70.31 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3210  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4520  inorganic anion transporter sulfate permease (SulP) family  70.31 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02679  hypothetical protein  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.431343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3017  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3044  sulfate permease family inorganic anion transporter  72.79 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0269  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.09 
 
 
449 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.373527  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3048  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.33 
 
 
451 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.26 
 
 
450 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.72 
 
 
450 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.26 
 
 
450 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1157  Xanthine/uracil/vitamin C permease  68.26 
 
 
450 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1236  xanthine/uracil permease family protein  68.26 
 
 
450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2812  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.81 
 
 
450 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1054  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.58 
 
 
450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.35 
 
 
450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173645  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3026  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.54 
 
 
452 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1058  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.12 
 
 
450 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2795  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.16 
 
 
452 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3356  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.8 
 
 
476 aa  564  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3523  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.02 
 
 
458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0601  xanthine/uracil family permease  67.67 
 
 
429 aa  550  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.474213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
429 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.72 
 
 
445 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.38 
 
 
431 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.16 
 
 
429 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  40.33 
 
 
429 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.42 
 
 
431 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  39.12 
 
 
445 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  38.89 
 
 
445 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.89 
 
 
445 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  38.89 
 
 
445 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.39 
 
 
429 aa  289  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.6 
 
 
445 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.08 
 
 
429 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.52 
 
 
431 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
429 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.35 
 
 
445 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.39 
 
 
429 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  37.95 
 
 
436 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 
429 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  38.18 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  38.57 
 
 
429 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  38.55 
 
 
442 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.39 
 
 
429 aa  286  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.32 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  38.18 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  38.32 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.39 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.91 
 
 
449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.91 
 
 
449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.93 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.14 
 
 
449 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  36.95 
 
 
444 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.72 
 
 
445 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.95 
 
 
470 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.95 
 
 
470 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>