More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0601 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0601  xanthine/uracil family permease  100 
 
 
429 aa  826    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.474213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4527  sulfate permease family inorganic anion transporter  74.36 
 
 
449 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3379  Xanthine/uracil/vitamin C permease  74.13 
 
 
455 aa  625  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000491987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03936  predicted permease  74.13 
 
 
449 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0175362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3928  Xanthine/uracil/vitamin C permease  74.13 
 
 
449 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03896  hypothetical protein  74.13 
 
 
449 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0267523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4619  sulfate permease family inorganic anion transporter  74.13 
 
 
449 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.5445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3963  xanthine/uracil/vitamin C permease  74.13 
 
 
449 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5568  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  74.13 
 
 
449 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4582  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  74.13 
 
 
449 aa  621  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3264  Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.9 
 
 
455 aa  623  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.033306  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4307  sulfate permease family inorganic anion transporter  74.13 
 
 
449 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4528  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  73.67 
 
 
449 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4614  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  73.67 
 
 
449 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4663  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  73.67 
 
 
449 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424808  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4612  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  73.67 
 
 
449 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.172522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4520  inorganic anion transporter sulfate permease (SulP) family  73.67 
 
 
449 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4431  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.44 
 
 
453 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.856106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0269  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.9 
 
 
449 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.373527  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0660  Xanthine/uracil/vitamin C permease  75.29 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.079445  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0426  xanthine/uracil/vitamin C permease  74.83 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0358  xanthine/uracil permease family protein  74.83 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1235  xanthine/uracil permease family protein  74.83 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0888  Xanthine/uracil/vitamin C permease  74.36 
 
 
455 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0819794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02717  predicted transporter  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0808  Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3017  sulfate permease family inorganic anion transporter  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4174  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3210  sulfate permease family inorganic anion transporter  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02679  hypothetical protein  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.431343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0824  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3044  sulfate permease family inorganic anion transporter  73.84 
 
 
455 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1157  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.53 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.53 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.53 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2812  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.63 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.07 
 
 
450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1236  xanthine/uracil permease family protein  68.6 
 
 
450 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3048  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.84 
 
 
451 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1054  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.91 
 
 
450 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.91 
 
 
450 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173645  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1058  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.67 
 
 
450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3356  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.3 
 
 
476 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3026  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.07 
 
 
452 aa  558  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3523  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.3 
 
 
458 aa  557  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0234  xanthine/uracil/vitamin C transporter  67.9 
 
 
462 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2795  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.37 
 
 
452 aa  554  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5304  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.97 
 
 
462 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.51043 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4989  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  66.51 
 
 
460 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5444  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.44 
 
 
462 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4759  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.97 
 
 
462 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.651751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4851  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.67 
 
 
462 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571866  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5418  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.44 
 
 
462 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  decreased coverage  0.00408682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.51 
 
 
462 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867027  normal  0.02261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2951  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  66.51 
 
 
460 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1523  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.28 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.322719  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0705  Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.82 
 
 
460 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0771  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.28 
 
 
460 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1821  xanthine/uracil/vitamin C permease  66.74 
 
 
465 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779574  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0755  hypothetical protein  64.2 
 
 
460 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.364664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4934  putative Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.36 
 
 
460 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  0.938879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 
429 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.95 
 
 
432 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 
429 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
431 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.61 
 
 
429 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
441 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.9 
 
 
431 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.67 
 
 
431 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.62 
 
 
431 aa  292  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 
429 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.67 
 
 
431 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.61 
 
 
429 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
431 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  39.76 
 
 
431 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.91 
 
 
431 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  39.48 
 
 
429 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  41.04 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.94 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.65 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.65 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.65 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.92 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  40.95 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  38.68 
 
 
449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.94 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.08 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.43 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.94 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  37.59 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.94 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  38.94 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  40.95 
 
 
431 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.94 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  38.94 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>