More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0660 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02717  predicted transporter  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03936  predicted permease  83.04 
 
 		 449 aa  733    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0175362  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0808  Xanthine/uracil/vitamin C permease  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3928  Xanthine/uracil/vitamin C permease  83.04 
 
 		 449 aa  734    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4612  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.14 
 
 		 449 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.172522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  74.5 
 
 		 450 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4663  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.14 
 
 		 449 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4307  sulfate permease family inorganic anion transporter  83.04 
 
 		 449 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1236  xanthine/uracil permease family protein  73.84 
 
 		 450 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1157  Xanthine/uracil/vitamin C permease  74.5 
 
 		 450 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02679  hypothetical protein  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.431343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03896  hypothetical protein  83.04 
 
 		 449 aa  733    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0267523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3379  Xanthine/uracil/vitamin C permease  89.45 
 
 		 455 aa  795    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000491987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  74.5 
 
 		 450 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3210  xanthine/uracil/vitamin C permease  74.06 
 
 		 450 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4989  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  75.06 
 
 		 460 aa  634    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1235  xanthine/uracil permease family protein  86.92 
 
 		 451 aa  753    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4527  sulfate permease family inorganic anion transporter  83.26 
 
 		 449 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4582  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.81 
 
 		 449 aa  731    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3044  sulfate permease family inorganic anion transporter  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0358  xanthine/uracil permease family protein  86.92 
 
 		 451 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4528  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.14 
 
 		 449 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4520  inorganic anion transporter sulfate permease (SulP) family  82.14 
 
 		 449 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0660  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 451 aa  867    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.079445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3264  Xanthine/uracil/vitamin C permease  89.67 
 
 		 455 aa  796    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.033306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5568  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  83.04 
 
 		 449 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4174  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3210  sulfate permease family inorganic anion transporter  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4614  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  82.14 
 
 		 449 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166887  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2812  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.17 
 
 		 450 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4431  xanthine/uracil/vitamin C permease  85.43 
 
 		 453 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.856106 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0269  xanthine/uracil/vitamin C permease  81.47 
 
 		 449 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.373527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0824  xanthine/uracil/vitamin C permease  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0888  Xanthine/uracil/vitamin C permease  96.04 
 
 		 455 aa  816    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0819794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0426  xanthine/uracil/vitamin C permease  86.92 
 
 		 451 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3963  xanthine/uracil/vitamin C permease  83.04 
 
 		 449 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4619  sulfate permease family inorganic anion transporter  83.04 
 
 		 449 aa  732    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.5445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3017  sulfate permease family inorganic anion transporter  84.63 
 
 		 455 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3048  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.84 
 
 		 451 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0234  xanthine/uracil/vitamin C transporter  73.59 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1054  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.51 
 
 		 450 aa  628  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.40133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.73 
 
 		 450 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0771  Xanthine/uracil/vitamin C permease  74.66 
 
 		 460 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811834  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5304  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.69 
 
 		 462 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.51043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4759  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.69 
 
 		 462 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.651751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1058  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.51 
 
 		 450 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0705  Xanthine/uracil/vitamin C permease  74.43 
 
 		 460 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4851  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.91 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4934  putative Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.76 
 
 		 460 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41731  normal  0.938879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5444  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.69 
 
 		 462 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.654627  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0601  xanthine/uracil family permease  75.29 
 
 		 429 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.474213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3026  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.53 
 
 		 452 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5418  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.69 
 
 		 462 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  decreased coverage  0.00408682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0755  hypothetical protein  70.86 
 
 		 460 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.364664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3349  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.23 
 
 		 462 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.867027  normal  0.02261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2795  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.97 
 
 		 452 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3356  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.46 
 
 		 476 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3523  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.65 
 
 		 458 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1523  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.2 
 
 		 460 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.322719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1821  xanthine/uracil/vitamin C permease  71.91 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779574  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2951  nucleobase/cation symporter, (NCS2) family  70.81 
 
 		 460 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.73 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.73 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  40.73 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.73 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.73 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  40.73 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  40.73 
 
 		 444 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.73 
 
 		 470 aa  309  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.02 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 		 429 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  39.48 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  41.2 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.28 
 
 		 431 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.32 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 		 429 aa  295  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.71 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  40.09 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  40.09 
 
 		 442 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.2 
 
 		 431 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  40.65 
 
 		 429 aa  292  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 		 429 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.68 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.24 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.83 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  40.74 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  40.51 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.87 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.76 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.47 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.47 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.63 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.26 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.51 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  39.77 
 
 		 431 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>