80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0036 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  100 
 
 		 222 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  99.09 
 
 		 220 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  70.67 
 
 		 225 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.13 
 
 		 252 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4208  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.51 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.82 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.12 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.4 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.8 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.8 
 
 		 160 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.27 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  27.27 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  34.19 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.25 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.22 
 
 		 366 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.96 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.71 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.12 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.292219  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.3 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  30.33 
 
 		 262 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.72 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1268  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.52 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.9 
 
 		 160 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.75 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.75 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.72 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.71 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  37.18 
 
 		 245 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.72 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1098  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 161 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.75 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  37.21 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  31.43 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0353  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.62 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0779084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.72 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  30.67 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.36 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.47 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  38.16 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  30 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  37.65 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.15 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.15 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.69 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.19 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  38.46 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  38.16 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.19 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.19 
 
 		 272 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.93 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.91 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.2 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  27.56 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.52 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.96 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  28.1 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0294  flagellar protein FlgA  31.46 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1095  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.42 
 
 		 268 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.99 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.57 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.14 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 139 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.2 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 139 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.47 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3475  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.1 
 
 		 326 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  0.226708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  43.66 
 
 		 343 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.27 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  29.41 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.65 
 
 		 416 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.23 
 
 		 360 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.23 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.55 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.4 
 
 		 355 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>