45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0393 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  100 
 
 		 416 aa  826    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  52.48 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2519  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  49.83 
 
 		 346 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3157  FlgA family protein  42.76 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.182361  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2408  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.86 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.43 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  29.58 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.77 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0396  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.28 
 
 		 233 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.45 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.84 
 
 		 138 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.57 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.77 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.4 
 
 		 169 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.77 
 
 		 262 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  29.03 
 
 		 243 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.57 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.53 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  30.53 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.5 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0670  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  28.33 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  28.75 
 
 		 281 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.92 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.77 
 
 		 214 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.91 
 
 		 235 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.77 
 
 		 214 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1098  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  39.68 
 
 		 161 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0332  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  24.6 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.41 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.25 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.22 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  25.78 
 
 		 246 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.35 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.51 
 
 		 235 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1140  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.21 
 
 		 152 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  25.86 
 
 		 230 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.78 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  24.31 
 
 		 230 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.47 
 
 		 148 aa  43.1  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.68 
 
 		 248 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.83 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.35 
 
 		 218 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.58 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  25.76 
 
 		 248 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1095  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 268 aa  43.1  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>