117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3365 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3365  thioesterase  100 
 
 		 285 aa  556  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  37.12 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  32.16 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1831  pyochelin biosynthetic protein  35.11 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2316  thioesterase II  33.77 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0766972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  30.05 
 
 		 252 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  35.37 
 
 		 251 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2147  pyochelin biosynthetic protein  32.14 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00348724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0873  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.14 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0783  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.14 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  33.04 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3366  thioesterase  32.02 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5001  thioesterase  32.02 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0435421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5286  thioesterase  31.44 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0605968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  31.88 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  36.49 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.47 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  32.33 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.39 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  25.71 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.62 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  34.07 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  25.86 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3863  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.86 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0181058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.78 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  28.63 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  30.95 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  31.72 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.26 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.17 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5687  thioesterase  33.06 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0638728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  32.87 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0755  thioesterase  25.98 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0687  putative thioesterase  25.98 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  32.87 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  31.17 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  31.17 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  31.17 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.71 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.71 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5926  thioesterase  30.77 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.023654  normal  0.0208655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  31.47 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  32.75 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  26.83 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  31.8 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  29.56 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  24.6 
 
 		 1337 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  30.23 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.18 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.17 
 
 		 2792 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  30.84 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1862  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.18 
 
 		 2832 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00326522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2168  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.18 
 
 		 2839 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0537  polyketide synthase  32.18 
 
 		 2835 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.725233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0440  polyketide synthase  32.18 
 
 		 2832 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.3 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1446  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.18 
 
 		 2839 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  30.41 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  28.77 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.72 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  28 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  28 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  28 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  28.17 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  21.37 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  28.35 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  32.33 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  27.31 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  31.7 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  30.37 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2296  Thioesterase  29 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  28.19 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  30.5 
 
 		 1414 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.14 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  23.76 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3848  thioesterase  28.23 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  28.14 
 
 		 829 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  29.68 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  30.37 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  25.69 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  32.86 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  25.59 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  31.3 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  31.3 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  30.7 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.21 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.23 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3099  Thioesterase  24.41 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.92 
 
 		 2125 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  28.17 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  28.17 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  26.02 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  25 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  29.22 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  31.31 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3469  thioesterase  28.57 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3532  thioesterase  28.57 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3480  thioesterase  28.57 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.128002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  27.23 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  28.57 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>