32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0964 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  92.86 
 
 		 375 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  94.05 
 
 		 336 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  92.86 
 
 		 336 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  79.46 
 
 		 335 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  69.94 
 
 		 335 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  69.64 
 
 		 335 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  71.92 
 
 		 337 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  61.61 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  61.31 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  45.32 
 
 		 346 aa  318  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  44.74 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  46.36 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  46.69 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  41.5 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  40.35 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  45.77 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  26.33 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  25.22 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  25.44 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  25.96 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  24.84 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  25.96 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  23.1 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  23.57 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  25.08 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  23.33 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  23.05 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3075  hypothetical protein  35.21 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153662  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  32.65 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  22.58 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  22.71 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>