32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0944 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  70.45 
 
 		 336 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  69.05 
 
 		 336 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  72.56 
 
 		 336 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  69.25 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  67.87 
 
 		 335 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  63.36 
 
 		 335 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  62.76 
 
 		 335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  62.16 
 
 		 335 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  61.7 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  45.88 
 
 		 346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  45.32 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  44.06 
 
 		 351 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  43.19 
 
 		 351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  45.15 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  43.94 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  43.89 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  24.7 
 
 		 331 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  23.87 
 
 		 331 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  23.87 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  23.48 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  23.37 
 
 		 329 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  24.21 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  21.69 
 
 		 329 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1182  hypothetical protein  23.78 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.155999 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  22.64 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0403  hypothetical protein  24.15 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2899  hypothetical protein  23.55 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0123115  hitchhiker  0.000697363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2347  hypothetical protein  21.36 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0842  hypothetical protein  21.3 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1695  hypothetical protein  21.85 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0466437  normal  0.4306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3691  hypothetical protein  20.83 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>