26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0113 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0114  hypothetical protein  74.84 
 
 		 329 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0687801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0109  hypothetical protein  76.38 
 
 		 329 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0118  hypothetical protein  65.51 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0117  hypothetical protein  64.87 
 
 		 331 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0113  hypothetical protein  64.24 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0114  hypothetical protein  66.67 
 
 		 177 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0943  hypothetical protein  25.77 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.367805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4962  hypothetical protein  24.46 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57070  hypothetical protein  24.53 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0964  hypothetical protein  25.44 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.198535  normal  0.689775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4381  hypothetical protein  25.53 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1846  protein of unknown function DUF481  26.51 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4367  hypothetical protein  24.46 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4492  hypothetical protein  24.16 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4076  hypothetical protein  25.08 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2264  hypothetical protein  25.98 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1357  hypothetical protein  23.75 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1200  hypothetical protein  25.47 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2570  hypothetical protein  24.47 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57060  hypothetical protein  22.6 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1764  hypothetical protein  27.46 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4961  hypothetical protein  22.29 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0944  hypothetical protein  22.74 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.659342  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0881  alanine racemase region  21.6 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.140785  hitchhiker  0.000185996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0527  hypothetical protein  20.72 
 
 		 346 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>